Kaynak
Bu rehber yardımcı oldu mu?
DoktorClub’da Keşfet
Genom Araştırması Sayesinde Yeni Kanser Tedavileri Mümkün
Bern Üniversitesi'nden araştırmacılar, insan genomunun "karanlık maddesini" analiz ederek yeni kanser tedavilerinin ana hatlarını çıkardılar. Kanser, İsviçre'de ikinci en yüksek ölüm nedenidir. Tüm kanserler arasında…
Bern Üniversitesi'nden araştırmacılar, insan genomunun "karanlık maddesini" analiz ederek yeni kanser tedavilerinin ana hatlarını çıkardılar. Kanser, İsviçre'de ikinci en yüksek ölüm nedenidir. Tüm kanserler arasında küçük hücreli olmayan akciğer kanseri çoğu durumda tedavi edilemiyor. Yeni onaylanmış tedaviler ömrü birkaç ay uzatabiliyor, ancak çok az hasta uzun süre hayatta kalabiliyor. Bu, Bern Üniversitesi araştırmacılarını yeni kanser tedavileri arayışında insan genomunu keşfetmeye teşvik etti.
Araştırmacılar, "uzun kodlamayan RNA'lar" (lncRNA'lar) olarak adlandırılan, yeterince anlaşılmamış ve az araştırılmış bir gen sınıfına yöneldiler. LncRNA'lar, insan genomunun çoğunu oluşturan "karanlık madde" veya protein kodlamayan DNA olarak bilinen şeyde bulunur. İnsan genomu yaklaşık 20.000 düzenli protein kodlayan gen ve 100.000 lncRNA içerir. Şu anda, lncRNA'ların biyolojik fonksiyonlarının %99'u bilinmemekte. lncRNA'lar kodlama yapmazlar, yani haberci RNA'ların (mRNA'lar) aksine proteinler için yapı planlarını kodlamazlar.
lncRNA'ların rolünü daha iyi anlamak için araştırmacılar, küçük hücreli olmayan akciğer kanserinde hangi lncRNA'ların bulunduğunu öğrenmek için veri kümelerini incelediler. Araştırmacılar çalışmak için 800'den fazla lncRNA belirlediler. DNA'daki yapım talimatlarının bir kısmını silerek seçilen lncRNA'ların üretimini engelleyen bir tarama sistemi geliştirdiler. Araştırmacılar, tarama sistemlerini hastalardan elde edilen iki küçük hücreli olmayan akciğer kanseri hücre hattına uyguladılar. Belirli lncRNA'ların hariç tutulmasının kanser hücrelerinin 'ayırt edici özelliklerini' nasıl etkilediğini incelediler. İşaretler, kanserin ilerlemesine katkıda bulunan hücresel davranışlardır. Bunlar proliferasyon, metastaz oluşumu ve tedaviye dirençtir.
Araştırmacılar, orijinal 800'den 80 yüksek güvenilir aday lncRNA buldu. 80'den birkaçı, bir takip deneyi için seçildi. Takip deneyleri, lncRNA'ların çoğunluğunun yok edilmesinin kanser hücresi bölünmesini inhibe ettiğini gösterdi. Aynı tedavi, yeni kanser tedavilerinden zarar görmemesi gereken kanserli olmayan akciğer hücreleri üzerinde çok az etkiye sahipti.
Çalışmanın ilk yazarlarından Taisia Polidori, “Antisens oligonükleotitlerin farklı modellerde tümör büyümesini ne kadar iyi sınırlayabildiğini görmek bizi çok şaşırttı.” dedi.
Araştırmacılar, klinik öncesi denemelerde yeni kanser tedavileri geliştirmeye devam edecekler ve yeni ilaçlar geliştirmek için yeni - mevcut şirketlerle işbirliği yapmayı umuyorlar. Araştırma ekibi ayrıca bulgularının diğer kanserlerle alakalı olacağına inanıyor.
Araştırmacılar, "uzun kodlamayan RNA'lar" (lncRNA'lar) olarak adlandırılan, yeterince anlaşılmamış ve az araştırılmış bir gen sınıfına yöneldiler. LncRNA'lar, insan genomunun çoğunu oluşturan "karanlık madde" veya protein kodlamayan DNA olarak bilinen şeyde bulunur. İnsan genomu yaklaşık 20.000 düzenli protein kodlayan gen ve 100.000 lncRNA içerir. Şu anda, lncRNA'ların biyolojik fonksiyonlarının %99'u bilinmemekte. lncRNA'lar kodlama yapmazlar, yani haberci RNA'ların (mRNA'lar) aksine proteinler için yapı planlarını kodlamazlar.
lncRNA'ların rolünü daha iyi anlamak için araştırmacılar, küçük hücreli olmayan akciğer kanserinde hangi lncRNA'ların bulunduğunu öğrenmek için veri kümelerini incelediler. Araştırmacılar çalışmak için 800'den fazla lncRNA belirlediler. DNA'daki yapım talimatlarının bir kısmını silerek seçilen lncRNA'ların üretimini engelleyen bir tarama sistemi geliştirdiler. Araştırmacılar, tarama sistemlerini hastalardan elde edilen iki küçük hücreli olmayan akciğer kanseri hücre hattına uyguladılar. Belirli lncRNA'ların hariç tutulmasının kanser hücrelerinin 'ayırt edici özelliklerini' nasıl etkilediğini incelediler. İşaretler, kanserin ilerlemesine katkıda bulunan hücresel davranışlardır. Bunlar proliferasyon, metastaz oluşumu ve tedaviye dirençtir.
Araştırmacılar, orijinal 800'den 80 yüksek güvenilir aday lncRNA buldu. 80'den birkaçı, bir takip deneyi için seçildi. Takip deneyleri, lncRNA'ların çoğunluğunun yok edilmesinin kanser hücresi bölünmesini inhibe ettiğini gösterdi. Aynı tedavi, yeni kanser tedavilerinden zarar görmemesi gereken kanserli olmayan akciğer hücreleri üzerinde çok az etkiye sahipti.
Çalışmanın ilk yazarlarından Taisia Polidori, “Antisens oligonükleotitlerin farklı modellerde tümör büyümesini ne kadar iyi sınırlayabildiğini görmek bizi çok şaşırttı.” dedi.
Araştırmacılar, klinik öncesi denemelerde yeni kanser tedavileri geliştirmeye devam edecekler ve yeni ilaçlar geliştirmek için yeni - mevcut şirketlerle işbirliği yapmayı umuyorlar. Araştırma ekibi ayrıca bulgularının diğer kanserlerle alakalı olacağına inanıyor.