Kaynak
Bu rehber yardımcı oldu mu?
DoktorClub’da Keşfet
Tümörlerin Genetik Haritalanması Kanserin Nasıl Büyüdüğünü Ortaya Koyuyor
Hangi hücrelerin hangi kanser bölgelerine yol açtığını anlamak, bir tümörün zaman içinde genetik olarak nasıl değiştiği de dahil olmak üzere nasıl büyüdüğü ve geliştiği konusundaki anlayışımızı geliştirebilir. Bu, bilim…
Hangi hücrelerin hangi kanser bölgelerine yol açtığını anlamak, bir tümörün zaman içinde genetik olarak nasıl değiştiği de dahil olmak üzere nasıl büyüdüğü ve geliştiği konusundaki anlayışımızı geliştirebilir. Bu, bilim insanlarının baktıkları dokuyu parçalamadan hangi genetik değişikliklerin meydana geldiğini görmelerini sağlayan, uzaysal transkriptomik adı verilen yeni bir teknik kullanılarak mümkün hale getirildi.
Tümörlerdeki hücrelerin genetiğini incelemek için mevcut teknikler, kanserli bölgeden bir örnek almayı ve bu hücrelerin DNA'sını analiz etmeyi içeriyor. Sorun, prostat kanseri gibi birçok kanserin üç boyutlu olmasıdır, bu da herhangi bir numunenin tümörün yalnızca küçük bir görüntüsünü vereceği anlamına gelir.
Nature'da yayınlanan ve Cancer Research UK tarafından finanse edilen yeni bir çalışmada, araştırmacılar, sağlıklı ve kanserli hücrelerin alanları da dahil olmak üzere tüm prostatın kesitsel bir haritasını oluşturmak için uzamsal transkriptomik kullandılar. Hücreleri benzer genetik kimliğe göre gruplandırarak, kanserin genetik özelliklerinin çoğuna zaten sahip olduğu varsayılan sağlıklı doku alanlarını gördüklerinde şaşırdılar. Bu bulgu, hem dokudaki genetik çeşitlilik hem de sağlıklı kabul edilebilecek, ancak genellikle kanserli hücrelerle tanımlanan mutasyonlar içeren çok sayıda hücre nedeniyle şaşırtıcıydı.
Çalışmayı ortaklaşa yürüten Oxford'un Nuffield Cerrahi Bilimleri Bölümü'nden Alastair Lamb şunları söyledi: “Prostat dokusu üç boyutludur ve kanser geliştirebilen çoğu organ gibi, hangi hücresel değişikliklerin kansere neden olduğu ve nerede başladığı hakkında hala öğrenecek çok şeyimiz var. Oldukça emin olduğumuz bir şey, bunun genetik mutasyonlarla başladığıdır. Daha önce hiç bu düzeyde bir çözünürlük elde etmemiştik ve bu yeni yaklaşım bazı şaşırtıcı sonuçlar ortaya çıkardı. Örneğin, daha önce özellikle kansere bağlı olduğunu düşündüğümüz kopya sayısı olaylarının çoğunun aslında iyi huylu dokuda zaten mevcut olduğunu bulduk. Bunun teşhiste ve ayrıca potansiyel olarak bir kanserin hangi parçalarının tedavi edilmesi gerektiğine karar vermek için büyük etkileri var.”
KTH Royal Institute of Technology'den Profesör Joakim Lundeberg de şunları söyledi: “Tek bir deneyde binlerce doku bölgesini haritalamak, tümörlerin heterojenliğini ve mikro-ortamını çözmek için eşi görülmemiş bir yaklaşımdır. Bu yüksek çözünürlüklü görünüm karmaşık ekosistemleri ele alma şeklimizi etkiler.”
Tümörlerdeki hücrelerin genetiğini incelemek için mevcut teknikler, kanserli bölgeden bir örnek almayı ve bu hücrelerin DNA'sını analiz etmeyi içeriyor. Sorun, prostat kanseri gibi birçok kanserin üç boyutlu olmasıdır, bu da herhangi bir numunenin tümörün yalnızca küçük bir görüntüsünü vereceği anlamına gelir.
Nature'da yayınlanan ve Cancer Research UK tarafından finanse edilen yeni bir çalışmada, araştırmacılar, sağlıklı ve kanserli hücrelerin alanları da dahil olmak üzere tüm prostatın kesitsel bir haritasını oluşturmak için uzamsal transkriptomik kullandılar. Hücreleri benzer genetik kimliğe göre gruplandırarak, kanserin genetik özelliklerinin çoğuna zaten sahip olduğu varsayılan sağlıklı doku alanlarını gördüklerinde şaşırdılar. Bu bulgu, hem dokudaki genetik çeşitlilik hem de sağlıklı kabul edilebilecek, ancak genellikle kanserli hücrelerle tanımlanan mutasyonlar içeren çok sayıda hücre nedeniyle şaşırtıcıydı.
Çalışmayı ortaklaşa yürüten Oxford'un Nuffield Cerrahi Bilimleri Bölümü'nden Alastair Lamb şunları söyledi: “Prostat dokusu üç boyutludur ve kanser geliştirebilen çoğu organ gibi, hangi hücresel değişikliklerin kansere neden olduğu ve nerede başladığı hakkında hala öğrenecek çok şeyimiz var. Oldukça emin olduğumuz bir şey, bunun genetik mutasyonlarla başladığıdır. Daha önce hiç bu düzeyde bir çözünürlük elde etmemiştik ve bu yeni yaklaşım bazı şaşırtıcı sonuçlar ortaya çıkardı. Örneğin, daha önce özellikle kansere bağlı olduğunu düşündüğümüz kopya sayısı olaylarının çoğunun aslında iyi huylu dokuda zaten mevcut olduğunu bulduk. Bunun teşhiste ve ayrıca potansiyel olarak bir kanserin hangi parçalarının tedavi edilmesi gerektiğine karar vermek için büyük etkileri var.”
KTH Royal Institute of Technology'den Profesör Joakim Lundeberg de şunları söyledi: “Tek bir deneyde binlerce doku bölgesini haritalamak, tümörlerin heterojenliğini ve mikro-ortamını çözmek için eşi görülmemiş bir yaklaşımdır. Bu yüksek çözünürlüklü görünüm karmaşık ekosistemleri ele alma şeklimizi etkiler.”