Birmingham Üniversitesi'nden araştırmacılar, eğlence mekanlarında, havaalanı varış terminallerinde ve klinik test laboratuvarlarının bulunmadığı uzak ortamlarda uygulanabilen yeni, son derece hassas bir COVID-19 test yönteminin hızını, doğruluğunu ve kullanım kolaylığını onayladılar.
Bilim insanları, Üstel Amplifikasyon Reaksiyonu (EXPAR) yönteminin şu anda hastane ortamlarında kullanılan hem PCR hem de LAMP testlerinden daha hassas ancak daha hızlı olduğunu doğrulamak için üç yönlü bir karşılaştırma çalışması kullandılar. RTF-EXPAR adı verilen Birmingham COVID-19 testi, mevcut yanal akış testlerinin daha az etkili olduğu düşük viral seviyeler için bile, bir numune için 10 dakikanın altında bir süreyle sinyal veriyor.
School of Biosciences'dan profesör Tim Dafforn ve School of Chemistry'den Jim Tucker, PNAS'ta yayınlanan çalışması üzerine lisansüstü öğrencisi Jake Carter ve Institute of Cancer and Genomic Sciences'dan Profesör Andrew Beggs ile çalıştı.
Hem PCR hem de LAMP testleri, ağızdan ve burundan alınan sürüntülerde son derece düşük seviyelerde bulunabilen viral RNA'yı tespit ediyor. Bu testler, önce RNA'nın DNA'ya dönüştürülmesini (ters transkripsiyon adı verilen bir işlem) ve ardından numunede tespit edilebilmesi için materyali birçok kez "büyütmesini" içeren iki aşamalı bir işlem kullanıyor.
Profesör Tim Dafforn şunları söyledi: “Hem ters transkripsiyon hem de amplifikasyon adımları, bu adımlara sahip olmayan yanal akış gibi antijen testlerine kıyasla, nükleik asit saptamasına dayalı mevcut COVID tahlillerini yavaşlatır. Ancak bu, yanal akış testlerini PCR ve LAMP'a dayalı olanlardan daha hızlı hale getirirken, karşılığında tipik olarak daha az hassastır. İdeal bir test, hem yeterince hassas hem de hızlı olandır - RTF-EXPAR adlı testimiz bu amaca ulaşıyor.”
Profesör Dafforn şunları da ekledi: "EXPAR, DNA'yı tek bir sıcaklıkta çoğaltır, böylece PCR'de bulunan uzun ısıtma ve soğutma adımlarından kaçınır. Bununla birlikte, LAMP ayrıca amplifikasyon için tek bir sıcaklık kullanırken, EXPAR, çok daha küçük ipliklerin amplifiye edildiği daha basit ve daha doğrudan bir işlemdir. Bu, EXPAR'ı yalnızca PCR'den değil, aynı zamanda LAMP'den de daha hızlı bir DNA amplifikasyon tekniği yapar.”
Çalışma, RTF-EXPAR yönteminin, mevcut test yöntemlerinde kullanılandan daha basit, tezgah üstü ekipmanla uyumlu tek kap bir tahlil kullanarak, 10 iplikli RNA'yı 10 dakikadan kısa sürede milyarlarca DNA kopyasına dönüştürdüğünü ortaya koydu.
Bilim insanları, Üstel Amplifikasyon Reaksiyonu (EXPAR) yönteminin şu anda hastane ortamlarında kullanılan hem PCR hem de LAMP testlerinden daha hassas ancak daha hızlı olduğunu doğrulamak için üç yönlü bir karşılaştırma çalışması kullandılar. RTF-EXPAR adı verilen Birmingham COVID-19 testi, mevcut yanal akış testlerinin daha az etkili olduğu düşük viral seviyeler için bile, bir numune için 10 dakikanın altında bir süreyle sinyal veriyor.
School of Biosciences'dan profesör Tim Dafforn ve School of Chemistry'den Jim Tucker, PNAS'ta yayınlanan çalışması üzerine lisansüstü öğrencisi Jake Carter ve Institute of Cancer and Genomic Sciences'dan Profesör Andrew Beggs ile çalıştı.
Hem PCR hem de LAMP testleri, ağızdan ve burundan alınan sürüntülerde son derece düşük seviyelerde bulunabilen viral RNA'yı tespit ediyor. Bu testler, önce RNA'nın DNA'ya dönüştürülmesini (ters transkripsiyon adı verilen bir işlem) ve ardından numunede tespit edilebilmesi için materyali birçok kez "büyütmesini" içeren iki aşamalı bir işlem kullanıyor.
Profesör Tim Dafforn şunları söyledi: “Hem ters transkripsiyon hem de amplifikasyon adımları, bu adımlara sahip olmayan yanal akış gibi antijen testlerine kıyasla, nükleik asit saptamasına dayalı mevcut COVID tahlillerini yavaşlatır. Ancak bu, yanal akış testlerini PCR ve LAMP'a dayalı olanlardan daha hızlı hale getirirken, karşılığında tipik olarak daha az hassastır. İdeal bir test, hem yeterince hassas hem de hızlı olandır - RTF-EXPAR adlı testimiz bu amaca ulaşıyor.”
Profesör Dafforn şunları da ekledi: "EXPAR, DNA'yı tek bir sıcaklıkta çoğaltır, böylece PCR'de bulunan uzun ısıtma ve soğutma adımlarından kaçınır. Bununla birlikte, LAMP ayrıca amplifikasyon için tek bir sıcaklık kullanırken, EXPAR, çok daha küçük ipliklerin amplifiye edildiği daha basit ve daha doğrudan bir işlemdir. Bu, EXPAR'ı yalnızca PCR'den değil, aynı zamanda LAMP'den de daha hızlı bir DNA amplifikasyon tekniği yapar.”
Çalışma, RTF-EXPAR yönteminin, mevcut test yöntemlerinde kullanılandan daha basit, tezgah üstü ekipmanla uyumlu tek kap bir tahlil kullanarak, 10 iplikli RNA'yı 10 dakikadan kısa sürede milyarlarca DNA kopyasına dönüştürdüğünü ortaya koydu.
Bu rehber yardımcı oldu mu?
DoktorClub’da Keşfet
