Her yıl bir milyar insanı etkileyen ve 1,5 milyon ölüme neden olan küresel mantar enfeksiyonları, savunmasızlığı artıran tıbbi tedavilerin sayısının artması nedeniyle artıyor. Organ nakli sonrası kemoterapi veya bağışıklık sistemini baskılayıcı tedavi gören hastalarda sıklıkla bağışıklık sistemi zayıflar. Dirençli suşların ortaya çıkması, mevcut antifungal ilaçların sınırlı çeşitliliği, maliyetleri ve yan etkileri göz önüne alındığında, bu enfeksiyonların tedavisi zorlayıcıdır ve daha etkili tedavilere acil bir ihtiyaç doğurmaktadır.
Bu bağlamda, Biyotıp Araştırma Enstitüsü'nden (IRB Barselona) ve Barselona Süper Bilgisayar Merkezi - Centro Nacional de Supercomputación'dan (BSC-CNS) ICREA araştırmacısı Dr. Toni Gabaldón liderliğindeki bir ekip, konu olan yüzlerce (mantar patojeni Candida'nın altı türünün yakın zamanda klinik olarak ilgili seçimine yönelik) gen belirledi. IRB Barselona ve BSC'deki Karşılaştırmalı Genomik laboratuvarı başkanı Dr. Gabaldón, “Bu çalışma, bu patojenlerin insanlara ve antifungal ilaçlara nasıl adapte olduğunu vurguluyor ve Candida enfeksiyonları için daha iyi tedavilerin önünü açacak değerli bilgiler sağlıyor.” diye açıklıyor.
6 Farklı Türden 2.000'den Fazla Genom
Çalışma, altı ana Candida türünün klinik örneklerinden yaklaşık 2.000 genomu analiz ederek Candida patojenlerinin evrimsel yapısını derinlemesine araştırıyor. Bu genomlar halka açık veritabanlarında saklanıyor. Araştırmacılar bu genomları bir referansla karşılaştırarak kapsamlı bir genetik varyant kataloğu oluşturdular.
İlaca dirençli suşları ele alan önceki çalışmalara dayanarak araştırmacılar, klinik izolatlarda antifungal ilaç direnciyle bağlantılı genetik varyantları belirlemek için Genom Genelinde Birlik Çalışması (GWAS) gerçekleştirdiler. Bu yaklaşım, üç Candida türünde yedi antifungal ilaca karşı hem bilinen hem de yeni direnç mekanizmaları hakkında bilgi sağladı.
Doktora sonrası araştırmacı Dr. Miquel Àngel Schikora-Tamarit şöyle açıklıyor: “Buna ek olarak, çalışmadan endişe verici bir bulgu ortaya çıktı: Duyarlı ve dirençli türler arasındaki çiftleşme yoluyla direncin potansiyel yayılımı, ilaca dirençli Candida patojenlerinin yaygınlığına katkıda bulunuyor.”
Buna ek olarak, klinik türler arasında yakın zamanda edinilen varyantlara odaklanan araştırmalar, insanla ilişkili ortamlarda gelişmek ve yayılmak için hangi adaptasyonların gerekli olabileceği konusunda bilgi veren, yakın zamandaki seçilimin ortak ve türe özgü genetik imzalarını da tespit etti.
Bu bağlamda, Biyotıp Araştırma Enstitüsü'nden (IRB Barselona) ve Barselona Süper Bilgisayar Merkezi - Centro Nacional de Supercomputación'dan (BSC-CNS) ICREA araştırmacısı Dr. Toni Gabaldón liderliğindeki bir ekip, konu olan yüzlerce (mantar patojeni Candida'nın altı türünün yakın zamanda klinik olarak ilgili seçimine yönelik) gen belirledi. IRB Barselona ve BSC'deki Karşılaştırmalı Genomik laboratuvarı başkanı Dr. Gabaldón, “Bu çalışma, bu patojenlerin insanlara ve antifungal ilaçlara nasıl adapte olduğunu vurguluyor ve Candida enfeksiyonları için daha iyi tedavilerin önünü açacak değerli bilgiler sağlıyor.” diye açıklıyor.
6 Farklı Türden 2.000'den Fazla Genom
Çalışma, altı ana Candida türünün klinik örneklerinden yaklaşık 2.000 genomu analiz ederek Candida patojenlerinin evrimsel yapısını derinlemesine araştırıyor. Bu genomlar halka açık veritabanlarında saklanıyor. Araştırmacılar bu genomları bir referansla karşılaştırarak kapsamlı bir genetik varyant kataloğu oluşturdular.
İlaca dirençli suşları ele alan önceki çalışmalara dayanarak araştırmacılar, klinik izolatlarda antifungal ilaç direnciyle bağlantılı genetik varyantları belirlemek için Genom Genelinde Birlik Çalışması (GWAS) gerçekleştirdiler. Bu yaklaşım, üç Candida türünde yedi antifungal ilaca karşı hem bilinen hem de yeni direnç mekanizmaları hakkında bilgi sağladı.
Doktora sonrası araştırmacı Dr. Miquel Àngel Schikora-Tamarit şöyle açıklıyor: “Buna ek olarak, çalışmadan endişe verici bir bulgu ortaya çıktı: Duyarlı ve dirençli türler arasındaki çiftleşme yoluyla direncin potansiyel yayılımı, ilaca dirençli Candida patojenlerinin yaygınlığına katkıda bulunuyor.”
Buna ek olarak, klinik türler arasında yakın zamanda edinilen varyantlara odaklanan araştırmalar, insanla ilişkili ortamlarda gelişmek ve yayılmak için hangi adaptasyonların gerekli olabileceği konusunda bilgi veren, yakın zamandaki seçilimin ortak ve türe özgü genetik imzalarını da tespit etti.
Kaynak
Bu rehber yardımcı oldu mu?
DoktorClub’da Keşfet
