Kanada ve İngiltere'den bir ekip, kanser tanısından yıllar önce alınmış kan örneklerinde DNA metilasyonu değişiklikleri saptadı. Prostat kanserinde sinyal orta düzeyde güçlü, meme kanserinde ise zayıftı. Sonuçlar…
Haberi paylaş
İlgilenecek birine ulaştırın.
Cell Genomics'te yayımlanan çalışma, prostat ve meme kanserinden yıllar önce alınan plazmada metilasyon sinyali buldu. Model, sonuçlar ve tarama uyarıları.
Kanada ve İngiltere'den bir ekip, kanser tanısından yıllar önce alınmış kan örneklerinde DNA metilasyonu değişiklikleri saptadı. Prostat kanserinde sinyal orta düzeyde güçlü, meme kanserinde ise zayıftı. Sonuçlar makine öğrenmesiyle kurulan risk modellerine dayanıyor ve dış doğrulama yok. Bu bir tarama testi değil; araştırma aşamasındaki bir risk sınıflama fikri.
Çalışma 21 Eylül 2026'da Cell Genomics dergisinde yayımlandı. İlk yazar Toronto Üniversitesi'nden Nicholas Cheng, son yazar Oxford Population Health'ten Philip Awadalla. Ontario Kanser Araştırma Enstitüsü ve Toronto Üniversitesi araştırmacıları da ekipte yer aldı. Oxford Üniversitesi bulguları 23 Eylül'de duyurdu.
Veriler Ontario Health Study (OHS) adlı ileriye dönük, toplum tabanlı kohorttan geliyor. Katılımcılar kan verdiklerinde kanser tanısı almamıştı. Ekip toplam 491 plazma örneğini inceledi: 93 örnek sonradan prostat kanseri, 171 örnek meme kanseri tanısı alan kişilere aitti. Kalan 227 örnek kanser geliştirmeyen kontrollerden alındı.
Kan alımı ile tanı arasındaki süre iki hafta ile dokuz yıl arasında değişti. Prostat kanserlerinin çoğu evre I–II, meme kanserlerinin yaklaşık üçte ikisi evre I idi.
Laboratuvar tarafında cfMeDIP-seq kullanıldı. Bu yöntem, kandaki hücre dışı DNA'nın (cfDNA, hücrelerden kana dökülen DNA parçaları) metillenmiş bölgelerini yakalayıp diziliyor. Metilasyon, gen düzenlenmesini etkileyen kimyasal bir işarettir.
Analitik kısım birkaç adımda ilerledi. Önce olgular ile cinsiyetle eşleştirilmiş kontroller arasında tüm genomda farklı metillenen bölgeler (DMR) arandı. En belirgin 2.000 hipermetile ve 2.000 hipometile bölge seçildi. Bu bölgeler, kamuya açık tümör dokusu verileriyle karşılaştırıldı: 502 prostat ve 846 meme tümörü, normal dokular ve kan lökositleri.
Ardından lojistik regresyon (olasılık tahmini yapan klasik bir sınıflandırıcı) modelleri kuruldu. Beş yıl içinde tanı alanların yaklaşık yüzde 70'i keşif setine ayrıldı. Geri kalan örnekler ayrı bir test setinde tutuldu. Keşif setinde 10 katlı çapraz doğrulama 100 kez tekrarlandı.
Prostat kanserinde en iyi sinyal susturucu (silencer) bölgelerden geldi. Test setinde AUC 0,73 bulundu; güven aralığı 0,59 ile 0,86 arasında geniş. Yüksek riskli grupta tehlike oranı 3,55 idi, ancak güven aralığının alt sınırı 1,00'e dayanıyordu.
Meme kanserinde güçlendirici (enhancer) bölgeler kullanıldı. Test AUC'si 0,58 idi; bu değer rastlantıya yakın. Tehlike oranı 2,3 bulundu ama istatistiksel olarak anlamlı değildi (p=0,09).
Yazarlar birçok sınırlılığı kendileri sıralıyor. Yüksek Gleason skorlu prostat ve üçlü negatif meme kanseri olguları azdı. Kontrollerin izlem süresi değişkendi ve bazılarında tanı almamış kanser olabilir. Bağımsız bir dış kohortta doğrulama yapılmadı.
2023'te ön baskı (hakem değerlendirmesinden geçmemiş sürüm) olarak paylaşılan önceki bir meme kanseri analizi çok daha yüksek AUC bildirmişti. Analiz kurguları birebir aynı olmayabilir. Yine de bu fark, ön baskı sonuçlarını temkinle okumak gerektiğini hatırlatıyor.
AUC, pozitif kestirim değerini (PKD, pozitif sonucun gerçekten hastalığa karşılık gelme olasılığı) göstermez. PKD, test edilen topluluktaki hastalık sıklığına bağlıdır. Bu çalışmadaki gibi olgu yönünden zenginleştirilmiş örneklerden çıkan tablo, genel topluma doğrudan aktarılamaz.
Makaledeki bir sayı bu noktayı somutlaştırıyor. Prostat modelinin yüksek risk grubunda beş yıllık tahmini insidans yüzde 5,7 idi. Yani bu grubun büyük çoğunluğu o sürede tanı almadı.
Aşırı tanı da ayrı bir risk. Erken bulunan her prostat kanseri klinik açıdan önemli değildir. Yazarlar da testi tek başına tarama aracı olarak değil, risk sınıflaması için önerdiklerini belirtiyor. Meme kanserinde mamografinin yerini alması beklenmiyor.
Hasta bu tür bir kan testini sorduğunda şu noktalar yol gösterebilir:
Bu çalışmadaki model ticari bir test değil ve klinik kullanım için doğrulanmadı.
Negatif sonuç, önerilen taramaları ertelemek için gerekçe olamaz.
Pozitif sonuç, ek görüntüleme ve biyopsi zincirini başlatabilir; zarar–yarar tartışılmalı.
Mevcut tarama önerileri değişmedi.
Bu modelin herhangi bir ülkede tanı testi olarak onaylandığına dair bilgi yok. Türkiye'de in vitro tanı cihazlarının denetimi Türkiye İlaç ve Tıbbi Cihaz Kurumu (TİTCK) çerçevesinde yürütülüyor.
Metilasyon ve dizileme verisi hassas bir veri türü. Kişisel Verilerin Korunması Kanunu (KVKK, 6698 sayılı) sağlık ve genetik verileri özel nitelikli kişisel veri sayar. Örneklerin ya da verinin yurt dışına gönderildiği hizmetlerde bu çerçeve dikkate alınmalı.
Çalışmadaki model bir araştırma aracı ve klinik kullanıma sunulmuş bir test değil. Dış kohortlarda doğrulanması ve klinik fayda göstermesi gerekiyor. Hastalar mevcut tarama önerilerini izlemeye devam etmeli.
Makalede prostat sinyali susturucu bölgelerde daha belirgin çıktı. Yazarlar, kan temelli testlerin erken evre meme kanserinde duyarlılığının sınırlı olduğunu belirtiyor. Kişi başına yalnızca 1,6 mL plazma kullanıldı; daha büyük hacimler duyarlılığı artırabilir.
Makine öğrenmesi, binlerce metilasyon bölgesinden kanser riskini ayıran bir örüntü seçmek için kullanıldı. Model lojistik regresyona dayanıyor ve ayrı bir test setinde sınandı. Bu, sonuçların aşırı iyimser olma riskini azaltır ama dış doğrulamanın yerini tutmaz.
Cheng N, Ouellette T, Skead K ve ark. (2026) — Pre-diagnosis plasma cell-free DNA reveals early signatures of prostate and breast cancer risk up to eight years prior to clinical detection, Cell Genomics: https://doi.org/10.1016/j.xgen.2026.101364
University of Oxford (2026) — Blood tests could identify early signs of cancer years before diagnosis (kurum duyurusu): https://www.ox.ac.uk/news/2026-09-23-blood-tests-could-identify-early-signs-of-cancer-years-before-diagnosis
University of Toronto Temerty Faculty of Medicine (2026) — Blood tests could identify early signs of cancer years before diagnosis: https://temertymedicine.utoronto.ca/news/blood-tests-could-identify-early-signs-cancer-years-diagnosis
Cheng N ve ark. (2023) — Pre-diagnosis plasma cfDNA methylome profiling up to seven years prior to clinical detection, medRxiv ön baskı: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.01.30.23285027v1
T.C. Mevzuat Bilgi Sistemi (2016) — 6698 sayılı Kişisel Verilerin Korunması Kanunu: https://www.mevzuat.gov.tr/mevzuatmetin/1.5.6698.pdf
News-Medical (2026) — Haber kaynağı: https://www.news-medical.net/news/20260923/Cancer-related-DNA-changes-may-appear-in-blood-years-before-diagnosis.aspx
Bu içerik bilgilendirme amaçlıdır ve bireysel tıbbi tavsiye yerine geçmez.
Bu konuyla ilgili Doktorclub'da ele aldığımız diğer hekim onaylı rehberler: