SARS-Cov-2'nin Replikasyon İçin İnsan Proteinlerini Nasıl Ele Geçirdiği Analiz Edildi

Bir araştırmacı ekibi, SARS-CoV-2'nin replikasyona yardımcı olmak ve yakındaki hücreleri enfekte etmek için konakçı hücrelerdeki proteinleri nasıl ele geçirdiğini analiz etti.

Bulgular, virüsün kendi replikasyonunu teşvik etmek ve yakındaki hücreleri enfekte etmek için hücrenin aktivitesini nasıl değiştirdiğini göstermektedir. Bilim adamları ayrıca, bu mekanizmaları bozabilecek ve klinik olarak onaylanmış ilaçların klinik çalışmalarda hemen test edilmesini önerebilecek yedi ilacı tanımladılar.

İşbirliği Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü (EMBL-EBI), California San Francisco Üniversitesi (UCSF) ABD, Howard Hughes Tıp Enstitüsü ABD, Fransa Enstitüsü (Pasteur) Fransa ve Freiburg Üniversitesi Almanya'daki araştırmacıları içeriyordu.

EMBL-EBI Grup Lideri Pedro Beltrao, “Virüs insan hücrelerinin bölünmesini önleyerek hücre döngüsünde belirli bir noktada tutar. Bu, virüse çoğalmaya devam etmek için nispeten istikrarlı ve yeterli bir ortam sağlar ”dedi. Bilim adamları, SARS-CoV-2 enfeksiyonundan sonra fosforilasyonda (bir proteine ​​kinaz adı verilen bir enzim tarafından bir fosforil grubunun eklenmesi) değişiklikler gösteren tüm konakçı ve viral proteinleri değerlendirmek için kütle spektrometrisini kullandılar. Virüs ile etkileşime giren konakçı proteinlerin yüzde 12'sinin modifiye edildiğini bulmuşlardır. Araştırmacılar ayrıca bu modifikasyonları düzenleme olasılığı en yüksek kinazları belirlediler.

Çalışmanın temel bulgularından biri, SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş hücrelerin uzun, dallı, kol benzeri uzantılar veya filopodi sergilemesidir. Araştırmacılara göre, bu yapılar virüsün vücuttaki yakındaki hücrelere ulaşmasına ve enfeksiyonu ilerletmesine yardımcı olabilir ancak bunu destekleyecek daha fazla çalışma yapılması gerekmektedir. UCSF Kantitatif Biyobilimler Enstitüsü Direktörü Nevan Krogan, “Filopodinin geniş dallanmasının belirgin şekilde görselleştirilmesi, virüs-konak etkileşiminin biyolojisinin anlaşılmasının hastalığa olası müdahale noktalarını aydınlatabileceğimizi bir kez daha ortaya koyuyor. Kinazlar, onları iyi ilaç hedefleri yapan belirli yapısal özelliklere sahiptir. Tanımladığımız kinazların bazılarını hedeflemek için ilaçlar zaten geliştirildi, bu nedenle klinik araştırmacıları bu ilaçların deneylerinde antiviral etkilerini test etmeye teşvik ediyoruz ” dedi.

Bazı hastalarda SARS-CoV-2, bağışıklık sisteminin aşırı reaksiyonuna neden olarak inflamasyona neden olur. İdeal bir tedavi, virüsün çoğalmasını durdururken bu abartılı enflamatuar semptomları hafifletmektir. Araştırmacılar, kinazların aktivitesini hedefleyen mevcut ilaçların her iki sorunun da çözümü olabileceğini söylüyor. Ekip, Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) tarafından onaylanan düzinelerce ilaç veya ilgili kinazları hedef alan devam eden klinik araştırmaları belirledi. Bu bileşiklerin yedisi, özellikle antikanser ve enflamatuar hastalık bileşikleri, laboratuvar deneylerinde güçlü antiviral aktivite göstermiştir.

Çalışma Cell'de yayınlandı.