Bilim Adamları, Topraklarda Gizlenen Nadir Dev Virüs Buldu

Massachusetts Amherst Üniversitesi'nden araştırmacılar yürütülen bir proje kapsamında bölgedeki zemin incelemeleri sonucu, şimdiye kadar keşfedilmemiş 16 yeni virüs türü keşfettiler.

Massachusetts'te, yaklaşık 30 yıldır dünyanın en uzun süren toprak ısınma deneyine ev sahipliği yapan bir orman bulunuyor. Araştırmacılar yaptıkları saha deneylerinde sıcak ortamda topraktaki küçük canlıların ne kadar etkilendiğini ölçüyor. Bu büyük boyutlu dış mekan araştırma laboratuvarında bilim adamları beklenmedik bir keşif yaptılar ve literatürde tamamen yeni olan 16 adet dev virüsü buldular. Massachusetts Amherst Üniversitesi'nden (UMass) biyolog Jeff Blanchard, “Amacımız, mikrobiyal toplulukların toprak ısınmasına tepki olarak nasıl değiştiğini anlamak için bakterileri doğrudan çevreden izole etmekti. Dev virüsleri aramıyorduk. Araştırmamız bir süre daha devam edecek” dedi.

Yakın zamana kadar bilinen gerçek, virüslerin bakterilerden oldukça küçük olduğuydu. Bununla birlikte, daha yakın zamanlarda dev virüslerin keşfi,  bilimsel kavramların bazılarına meydan okuyor. Araştırmacılar çok daha büyük fiziksel formlarda (bakterilere rakip) ve çok daha büyük ve daha karmaşık genomlarda da yaşayan, bilinmeyen viral suşları bulmaya devam ediyor. Bu devasa virüsler sadece bu yüzyılda keşfedildi ve şimdiye kadar genellikle sulu habitatlarda bulundular. Bu nedenle, Harvard Ormanı keşfinin önemi, olağanüstü bir virüsün karasal bir ekosistemde ve toprakta ilk defa bulunmasıyla dikkat çekici. 

Energy's Joint Genome Institute (JGI) departmanından biyoinformatikist Frederik Schulz, "Burada tek bir örnekleme bölgesinden üretilen metagenomik veriler, bugüne kadar gördüğüm diğer veri setlerinden çok daha fazla yeni dev virüs genomu içeriyordu. Biz bu çalışmada 16 ayrı dev virüs genomu elde ettik; ama biz sadece yüzeyi inceledik. Eğer aynı alanda daha fazla örnek alırsak bu sayı kolayca iki-üç katına çıkar" diyor. Mikropları tanımlamak için araştırmacılar, DNA'ya bağlanan toksik olmayan bir boya içeren bir çözelti içinde örnekleri askıya aldılar ve tek tek hücreleri izole etmek için floresanla aktive edilen hücre sınıflandırması (FACS) adı verilen bir teknik kullandılar. Mini-metagenomik olarak bilinen ek bir yöntem kullanan ekip, yaklaşık 2,000 bireysel hücrenin DNA'sını sıralamasını yaparak şimdiye kadar bilimin bilmediği 16 dev virüsü keşfettiler. 

Kaynak: https://www.sciencealert.com/