Penn State'teki bilim insanları, bir damla kandaki HIV viral yükünü doğrudan ölçmelerini sağlayan bir tahlil geliştirdiler. Teknoloji ayrıca mevcut yaklaşımlardan daha hızlı ve daha ucuzdur. Şu anda, RT-PCR tipik olarak bir hastanın kanındaki HIV seviyelerini değerlendirmek için kullanılıyor ve ölçülebilmesi için genetik materyalin amplifiye edilmesini gerektiriyor. Bu zaman alıcıdır ve viral yüklerin doğrudan bir ölçümünü sağlamaz, bunun yerine yakın bir tahmin sağlar. Self-digitization Through Automated Membran-based Partitioning (STAMP) adı verilen bu yeni teknoloji, sadece bir damla kandaki viral seviyeleri doğrudan ölçmeyi hedefliyor. Teknoloji, viral RNA'nın CRISPR-Cas sisteminin bir parçası olan Cas13 proteini ile karıştırılmasını içeriyor. Cas13 proteini, HIV RNA'nın varlığıyla etkinleştirildiğinde, ölçülebilir bir sinyalle sonuçlanan bir raportör molekülü parçalayacaktır. Tahlil daha hızlı, daha ucuz ve RT-PCR'den daha az kan gerektiriyor.

HIV viral yüklerinin ölçülmesi, tedavi sırasında hastanın ilerlemesini izlemede önemli bir adımdır. İşlerin gerektiği gibi ilerlediğinden emin olmak için tedavi sırasında viral yükü birkaç kez ölçmek gerekir. Bununla birlikte, bunu başarmak için tipik olarak RT-PCR içeren mevcut testler, zaman alıcıdır, çalıştırması pahalıdır ve viral yükün doğrudan bir ölçümünü sağlamaz, bunun yerine vekil bir tahmin sağlar.

Bu araştırmacılar, daha doğrudan, çalıştırması daha hızlı ve daha ucuz bir teşhis teknolojisi yaratmak için CRISPR-Cas sistemine yöneldiler. CRISPR-Cas sistemi, bir gen düzenleme aracı olarak iyi bilinir hale geliyor, ancak aynı zamanda, genetik materyali son derece spesifik olarak tanımlama ve manipüle etme yeteneği nedeniyle teşhis teknolojilerinde de bir rolü var.

Penn State'in STAMP tahlili, HIV RNA'nın Cas13 proteini ile karıştırılmasını içeriyor. Daha sonra araştırmacılar numunenin üzerine nano gözenekler içeren bir polikarbonat membran yerleştiriyorlar. Gözenekler o kadar küçük ki, Cas13 proteinine bağlı bir RNA molekülü içeren küçük bir damlacığın girmesine izin veriyorlar. HIV RNA'nın varlığında, Cas13 proteini aktive oluyor, bir haberci molekülü ayırıyor ve nano gözenekle çevrili damlacıkların içinde görülebilen ölçülebilir bir sinyal oluşturuyor. Projede yer alan bir araştırmacı olan Weihua Guan, “Bu sinyali gösteren damlacıkların sayısını sayarak, kişinin kanındaki HIV miktarını belirleyebiliriz. Tespit sınırını artırmak ve kurulumu otomatikleştirmek için daha fazla iyileştirmeye ihtiyaç duyulsa da, STAMP tabanlı dijital CRISPR yöntemi, HIV viral yük izlemeyi ilerletmek için büyük potansiyel gösteriyor.” dedi.

Kaynak: https://www.medgadget.com/